NITE DOGAN
Whole-genome (AP011615)
Fujisawa, T. et al. 2010. Genomic structure of an economically important cyanobacterium,
Arthrospira (Spirulina)
platensis NIES-39. DNA Res., 17:85-103.
Whole-genome (BBPA00000000)
Okano, K., Miyata, N., Ozaki, Y. 2015. Whole genome sequence of the non-microcystin-producing
Microcystis aeruginosa strain NIES-44. GenomeA, 3, e00135-15.
Whole-genome (AZYY00000000)
Cao, H. et al. 2014. Draft genome sequence of the toxic bloom-forming cyanobacterium
Aphanizomenon flos-aquae NIES-81. GenomeA, 2, e00044-14.
Plastid DNA (EU168190, NC_010772)
Cattolico, R. A., Jacobs, M. A., Zhou, Y., Chang, J., Duplessis, M., Lybrand, T., McKay, J., Ong, H. C., Sims, E., Rocap, G. 2008. Chloroplast genome sequencing analysis of
Heterosigma akashiwo CCAM452 (West Atlantic) and NIES293 (West Pacific) strains. BMC Genomics, 9, 211-230.
高等植物に最も近縁な車軸藻綱の最も原始的なグループ。単細胞、２鞭毛性で、体は鱗片に覆われる。
Mitochondria DNA (AF353999)
Plastid DNA (AF166114)
アオサ藻綱に属する海産の群体性緑藻で、4本鞭毛をもつ細胞が4個いかだ状に並んだ体制をもつ。
Mitochondoria DNA (DQ365900)
Plastid DNA (DQ291132)
原始的な緑色植物であるプラシノ藻類の仲間で、単細胞性、体は鱗片に覆われ、不等長の２鞭毛を持つ。ヘテロタリックで、有性生殖が知られている。
Mitochondoria DNA (AF110138)
Plastid DNA (AF137379)
富栄養化した湖沼で大発生し、アオコを形成する代表的なシアノバクテリアで、単細胞でガス胞をもち、水面に浮遊、集積する。また、本株はミクロキスチンと呼ばれる肝臓毒をもっている。
富栄養化した湖沼で大発生し、アオコを形成する代表的なシアノバクテリアで、単細胞でガス胞をもち、水面に浮遊、集積する。また、本株はミクロキスチンと呼ばれる肝臓毒をもっている。 かずさDNA研究所、筑波大学、国立環境研究所の共同研究チームによって、2007年にゲノムの完全解読が終了した。
Microcystisのゲノムは約６００万塩基対からなる環状DNAで、タンパク質をつくる遺伝子は６,３２５個ある。トランスポゾンと呼ばれる「動く遺伝子」が多く、ゲノムの12％にも及んでいること、これとは対照的に、環境の変化に応答するセンサーの役割を果たすタンパク質や応答反応を制御する役割を果たすタンパク質をコードする遺伝子が極端に少ないことが特徴となっている。また、ミクロシスティスが生産する毒素「ミクロシスチン」の合成に関わる遺伝子群も、見つかっている。
CyanoBase
Mitochondria DNA (AB930144)
Nishimura, Y., Kamikawa, R., Hashimoto, T., Inagaki, Y. 2014. An intronic open reading frame was released from one of group II introns in the mitochondrial genome of the haptophyte
Chrysochromulina sp. NIES-1333. Mobile Genetic Elements, 4, e29384 (article ID).
Mitochondria DNA (NC_021108, JX977845)
Plastid DNA (NC_021109, JX977846)
Smith, D. R., Hamaji, T., Olson, B. J., Durand, P. M., Ferris, P., Michod, R. E., Featherston, J., Nozaki, H., Keeling, P. J. 2013. Organelle genome complexity scales positively with organism size in volvocine green algae. Mol. Biol. Evol., 30, 793-797.
単細胞性、非窒素固定型、最適増殖温度が57℃の好熱性シアノバクテリアで、大分県別府温泉から分離された。 2002年に、BP-1株としてゲノム解読が終了している。
Thermosynechococcusのゲノムは、2,593,857塩基対からなる環状DNAで、タンパク質をコードする遺伝子は2,475個知られている。
CyanoBase
Plastid DNA (AP012987, NC_023133)
Tajima, N. et al. 2014. Analysis of the complete plastid genome of the unicellular red alga
Porphyridium purpureum. J. Plant Res., 127:389-397.
2本鞭毛をもつ、単細胞性の緑藻（緑藻綱）で、古くから光合成や遺伝の研究に用いられてきた。 本株は東京大学分子細胞生物学研究所IAM C-9株に由来し、かずさDNA研究所と京都大学の共同研究でEST解析が行われている。
Chlamydomonas reinhardtii EST index
ChlamyBase
Klebsormidium flaccidum genome project
Whole-genome (BANV00000000)
Mitochondria DNA (DF238763)
Plastid DNA (DF238762)
Hori, K. et al. 2014. Klebsormidium flaccidum genome reveals primary factors for plant terrestrial adaptation. Nat. Commun.
Whole-genome (CP011304)
Yamaguchi, H. et al. 2015. Complete genome sequence of Microcystis aeruginosa NIES-2549, a bloom-forming cyanobacterium from lake Kasumigaura, Japan. GenomeA, 3, e00551-15.
Mitochondoria DNA (AP012493, NC_020437)
Plastid DNA (AP012494, NC_020438)
Hamaji, T. et al. 2013. Mitochondrial and Plastid Genomes of the Colonial Green Alga,
Gonium pectorale Give Insights into the Origins of Organelle DNA Architecture within the Volvocales. PLoS ONE, 8: e57177.
Cyanidioschyzonは、高温（45-50℃）、強酸性（pH1.0-3.0）の環境に生息する微小な単細胞紅藻で、 核、ミトコンドリア、葉緑体、小胞体、ゴルジ体、マイクロボディ、リソソームなどの細胞小器官を１つずつ含む極めて単純な体制をもつ。
Cyanidioschyzonは、高温（45-50℃）、強酸性（pH1.0-3.0）の環境に生息する微小な単細胞紅藻で、 核、ミトコンドリア、葉緑体、小胞体、ゴルジ体、マイクロボディ、リソソームなどの細胞小器官を１つずつ含む極めて単純な体制をもつ。 立教大学黒岩常祥教授らのチームによって、10D株として、葉緑体、ミトコンドリア、核のゲノム解読が終了している。
染色体数は20で、核ゲノムは16,546,747塩基対、タンパク質をコードする遺伝子は4,775個である。 イントロンが非常に少なく、rRNA遺伝子は3コピーしか持たないという特徴をもつ。
Cyanidioschyzon merolae Genome Project
Whole-genome (AP014815-AP014820)
Hirose, Y. et al. 2015. Complete genome sequence of cyanobacterium Geminocystis sp. strain NIES-3708, which performs type II complementary chromatic acclimation. GenomeA, 3, e00357-15.
Whole-genome (AP014821-AP014832)
Hirose, Y. et al. 2015. Complete genome sequence of cyanobacterium Geminocystis sp. strain NIES-3709, which harbors a phycoerythrin-rich phycobilisome. GenomeA, 3, e00385-15.