Strain Data

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Strain number NIES-267  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Calothrix parasitica Thuret ex Bornet & Flauhault  
Synonym  
Former name  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Oshoro Bay, Hokkaido, Japan (1972-07-**)  
Latitude / Longitude  
Habitat (Isolation source) Marine (Seaweed)  
History < IAM (1983);  
Isolator (Date of isolation) Watanabe, Makoto M.; Ichimura, Terunobu (1972-07-**)  
Identified by Watanabe, Makoto M.  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Axenic[2014 Feb]  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  f/2  
Temperature:  20 (20) C
Light intensity:  4-10 (13-21) µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  6 M (21 D)  
Gene information Whole-genome ( AP018232 ) , nearly complete genome ( AP018227 ) , Plasmid DNA ( AP018228-AP018232 )  
Cell size (min - max) - 11 μm  
Organization Filamentous 
Characteristics Endophyte in Nemalion (Rhodophyceae) ; Genome decoded strain  
Other strain no. Other collection strain no. : IAM M-172 (=M-226)
 
Remarks Cryopreserved; Axenic 
Movie  
Reference
Nowruzi, B., Hutarova, L., Vešelenyiova, D., Metcalf, J. S. 2024 Characterization of Neowestiellopsis persica A1387 (Hapalosiphonaceae) based on the cpcA, psbA, rpoC1, nifH and nifD gene sequences. BMC Ecol. Evol., 24, 57 (article ID).
Keywords: Cyanobacteria; Phylogenetic analysis; Neowestiellopsis persica, cpcA
Strain(s): 21,  22,  23,  25,  50,  73,  267,  592,  2098,  2100,  2107,  3275,  3754,  3756,  3974,  4073,  4074,  4101,  4103,  4106 
PubMed: 38711016
DOI: 10.1186/s12862-024-02244-z

Okuda, Y., Hiraiwa, M., Shimizu, N., Hashimoto, S. 2023 Production of volatile organic iodine compounds by the marine cyanobacterium Calothrix parasitica under different light intensities. Mar. Chem., 248, 104211 (article ID).
Keywords: Iodinated hydrocarbons; Halogenated hydrocarbons; Light effects; Phytoplankton
Strain(s): 267 
DOI: 10.1016/j.marchem.2023.104211

Arsın, S., Delbaje, E., Jokela, J., Wahlsten, M., Farrar, Z. M., Permi, P., Fewer, D. 2023 A plastic biosynthetic pathway for the production of structurally distinct microbial sunscreens. ACS Chem. Biol., 18, 1959–1967.
Strain(s): 25,  73,  267,  2100,  2107,  2109,  2111,  2130,  3755,  3756,  3757,  3974,  4073,  4102,  4103,  4105,  4106 
PubMed: 37603862
DOI: 10.1021/acschembio.3c00112

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Keywords: photosystem II; chlorophyll; free radical; cyanobacteria; oxygen evolution center; chlorophyll f biosynthesis
Strain(s): 267 
PubMed: 37764149
DOI: 10.3390/microorganisms11092305

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Strain(s): 267 
PubMed: 36292802
DOI: 10.3390/genes13101917

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Keywords: Ammonium; cyanobacteria; glutamine synthetase; limitation; nitrate reductase; nitrite reductase; NtcA regulation; N metabolism
Strain(s): 25,  50,  204,  267,  843,  970,  981,  2107,  2134,  2135,  2481,  2549,  3709,  3754,  3756,  3757,  4074 
PubMed: 35595516
DOI: 10.1093/jxb/erac219

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Keywords: Bayesian phylogenetics; cyanobacteria; Paleoproterozoic; photoprotection; scytonemin; UVA radiation
Strain(s): 21,  23,  25,  26,  267,  2108,  2111,  3756,  4073,  4074,  4075,  4103 
PubMed: 35851984
DOI: 10.1111/gbi.12514

Hirose, Y., Ohtsubo, Y., Misawa, N., Yonekawa, C., Nagao, N., Shimura, Y., Fujisawa, T., Kanesaki, Y., Katoh, H., Katayama, M., Yamaguchi, H., Yoshikawa, H., Ikeuchi, M., Eki, T., Nakamura, Y., Kawachi, M. 2021 Genome sequencing of the NIES Cyanobacteria collection with a focus on the heterocyst-forming clade. DNA Res., 28, dsab024 (article ID).
Keywords: Cyanobacteria; genome; heterocyst; culture collection; taxonomy
Strain(s): 19,  21,  22,  23,  25,  37,  50,  73,  267,  806,  932,  2098,  2100,  2107,  2109,  2111,  2130,  2135,  3275,  3585,  3757,  3974,  4070,  4073,  4074,  4075,  4101,  4102,  4103,  4106 
PubMed: 34677568
DOI: 10.1093/dnares/dsab024

Li, Y. & MChen, M. 2021 The specificity of the bilin lyase CpcS for chromophore attachment to allophycocyanin in the chlorophyll f-containing cyanobacterium Halomicronima hongdechloris. Photosynth. Res., 151, 213–223.
Keywords: Allophycocyanin; Bilin lyase; Cyanobacteria; Far-red light photoacclimation; Halomicronema hongdechloris; Photosynthesis
Strain(s): 22,  267 
PubMed: 34564824
DOI: 10.1007/s11120-021-00878-4

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Strain(s): 21,  22,  25,  26,  30,  39,  44,  73,  87,  88,  267,  592,  806,  843,  932,  970,  2098,  2100,  2107,  2108,  2111,  2549,  3275,  3754,  3756,  3974,  4073,  4074,  4075,  4101,  4103,  4106 
PubMed: 31899489
DOI: 10.1093/molbev/msz308

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Strain(s): 267,  593,  3974 
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DOI: 10.1038/s41396-020-0670-y

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Keywords: cyanobacteria; homospermidine; polyamine; spermine; thermospermine
Strain(s): 26,  33,  36,  46,  206,  208,  230,  267,  268,  305,  361,  416,  433,  434,  481,  507,  597,  598,  931,  932,  1031,  2115,  2133,  2135 

Mori, F., Erata, M., Watanabe, M. M. 2002 Cryopreservation of cyanobacteria and green algae in the NIES-Collection. Microbiol. Cult. Coll., 18, 45-55.
Keywords: cryopreservation; cyanobacteria; green algae; FDA staining method; NIES-Collection
Strain(s): 19,  21,  22,  23,  24,  25,  26,  27,  28,  29,  30,  31,  32,  33,  34,  35,  36,  37,  38,  39,  40,  41,  44,  45,  46,  50,  51,  52,  53,  54,  55,  56,  58,  59,  60,  61,  62,  63,  64,  65,  66,  67,  68,  69,  70,  73,  74,  75,  76,  77,  78,  79,  80,  81,  87,  89,  90,  91,  92,  93,  94,  95,  96,  97,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  119,  120,  122,  123,  125,  127,  128,  129,  130,  131,  132,  133,  134,  135,  137,  138,  139,  144,  147,  151,  152,  153,  154,  155,  156,  157,  158,  159,  160,  162,  163,  164,  165,  166,  167,  168,  170,  171,  172,  173,  174,  175,  176,  177,  178,  179,  180,  181,  182,  183,  185,  186,  187,  188,  189,  191,  192,  193,  194,  197,  198,  199,  200,  201,  202,  203,  204,  205,  206,  207,  208,  209,  210,  211,  212,  213,  214,  215,  216,  217,  224,  226,  227,  228,  229,  230,  231,  232,  241,  242,  243,  244,  245,  246,  248,  257,  259,  261,  263,  266,  267,  268,  287,  288,  289,  290,  294,  295,  297,  298,  299,  300,  301,  302,  303,  305,  306,  308,  309,  310,  312,  313,  329,  334,  337,  338,  339,  340,  341,  342,  349,  351,  359,  360,  361,  362,  375,  378,  379,  380,  382,  384,  385,  390,  394,  396,  397,  398,  415,  416,  418,  419,  421,  422,  423,  424,  425,  426,  427,  428,  429,  430,  431,  432,  433,  434,  436,  437,  438,  439,  440,  446,  447,  448,  449,  450,  451,  452,  453,  454,  455,  456,  457,  458,  459,  460,  464,  468,  469,  474,  478,  479,  480,  481,  503,  504,  505,  506,  507,  509,  510,  512,  514,  515,  522,  523,  524,  527,  528,  529,  530,  531,  532,  536,  537,  538,  539,  540,  541,  542,  543,  544,  545,  546,  564,  565,  566,  567,  568,  569,  570,  571,  572,  573,  574,  575,  576,  577,  578,  579,  580,  581,  582,  583,  584,  585,  592,  593,  594,  595,  596,  597,  598,  604,  610,  628,  630,  631,  632,  633,  634,  635,  636,  637,  638,  639,  640,  641,  642,  643,  644,  645,  646,  647,  648,  649,  650,  651,  652,  653,  654,  655,  656,  657,  658,  659,  660,  661,  662,  663,  664,  665,  666,  667,  672,  685,  686,  687,  688,  689,  690,  691,  692,  693,  694,  717,  718,  719,  720,  721,  722,  723,  724,  725,  726,  727,  728,  729 

Ichimura, T. & Itoh, T. 1977 17. Preservation methods of microalgae (I) [17. Bisaisôrui no hozonhô (I)]. In Preservation methods of microorganisms [Biseibutsu Hozonhô], Ed. by Nei, T., University of Tokyo Press, Tokyo, pp. 355-373 (in Japanese).
Strain(s): 19,  21,  22,  23,  24,  27,  28,  30,  31,  32,  33,  34,  36,  37,  38,  39,  40,  41,  44,  45,  46,  47,  48,  49,  50,  122,  123,  127,  131,  144,  152,  173,  175,  179,  180,  181,  182,  183,  185,  198,  200,  203,  206,  217,  226,  227,  241,  266,  267,  268,  295,  309,  310,  334,  338,  379,  436,  448,  450,  455,  527 

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