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株番号 NIES-3808  
門名 Dinophyta  
綱名 Dinophyceae 
学名 Symbiodinium minutum T.C.LaJeunesse, J.E.Parkinson & J.D.Reimer  
シノニム  
以前使われていた種名  
一般名 渦鞭毛藻  
地名(採集年月) 米国 フロリダ Tennessee Reef(水深-22m), Florida Keys (2002-10-20)  
緯度/経度 24.74001666 /  
生息環境(分離源) 海域 (サンゴ)  
分離後の履歴 ← 將口栄一 ← Coffroth, M. A.  
分離者(分離年月) Coffroth, M. A. (2002-10-22)  
同定者 Coffroth, M. A.  
株の状態 継代培養; 非無菌; 単藻; クローン  
培養条件
(前培養条件)
培地名:  f/2  
温度: 20 ℃
光強度: 19 µmol photons/m2/sec,  明暗周期: 10L:14D
継代培養周期: 30 D  
遺伝子情報 Whole-genome ( BASF00000000 ) , Plastid minicircle sequences ( JX094304-JX094335 ) , CO1 ( LC002801 ) , CO3 ( LC002802 ) , BAC paired-end sequences ( GA393224-GA453876 ) , Fosmid paired-end sequences ( GA453877-GA605429 )  
特性 共生 (サンゴ) ; ゲノム解読株 (Shoguchi et al. 2013) ; Clade B  
サイズ (min - max)  
体制 単細胞性 
その他の株番号 その他の株番号:Mf1.05b.01  
注意事項 輸送時の衝撃に弱い  
動画  
文献
Shoguchi, E., Shinzato, C., Hisata, K., Satoh, N., Mungpakdee, S. 2015 The large mitochondrial genome of Symbiodinium minutum reveals conserved noncoding sequences between dinoflagellates and Apicomplexans. Genome Biol. Evol., 7, 2237-2244.
キーワード: Symbiodinium; Plasmodium; mitochondrial genome expansion; RNA editing; gene map; noncoding
Strain(s): 3808 
PubMed: 26199191
DOI: 10.1093/gbe/evv137

Mungpakdee, S., Shinzato, C., Takeuchi, T., Kawashima, T., Koyanagi, R., Hisata, K., Tanaka, M., Goto, H., Fujie, M., Lin, S., Satoh, N., Shoguchi, E. 2014 Massive gene transfer and extensive RNA editing of a symbiotic dinoflagellate plastid genome. Genome Biol. Evol., 6, 1408-1422.
キーワード: RNA editing; plastid-associated genes; dinoflagellate; Symbiodinium minutum; hydropathy; light-harvesting complex proteins; minicircles
Strain(s): 3808 
PubMed: 24881086
DOI: 10.1093/gbe/evu109

Shoguchi, E., Shinzato, C., Kawashima, T., Gyoja, F., Mungpakdee, S., Koyanagi, R., Takeuchi, T., Hisata, K., Tanaka, M., Fujiwara, M., Hamada, M., Seidi, A., Fujie, M., Usami, T., Goto, H., Yamasaki, S., Arakaki, N., Suzuki, Y., Sugano, S., Toyoda, A., Kuroki, Y., Fujiyama, A., Medina, M., Coffroth, M. A., Bhattacharya, D., Satoh, N. 2013 Draft assembly of the Symbiodinium minutum nuclear genome reveals dinoflagellate gene structure. Curr. Biol., 23, 1399–1408.
Strain(s): 3808 
PubMed: 23850284
DOI: 10.1016/j.cub.2013.05.062

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