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株番号 NIES-1333  
門名 Haptophyta  
綱名 Prymnesiophyceae 
学名 Chrysochromulina sp.  
シノニム  
以前使われていた種名  
一般名 ハプト藻  
地名(採集年月) 日本 東京湾 (2003-10-16)  
緯度/経度  
生息環境(分離源) 海域 (海水)  
分離後の履歴 ← TKB;  
分離者(分離年月) 岡本典子 (2003-12-**)  
同定者 岡本典子  
株の状態 継代培養; 非無菌; 単藻; 非クローン  
培養条件
(前培養条件)
培地名:  ESM  
温度: 20 ℃
光強度: 4-5 µmol photons/m2/sec,  明暗周期: 10L:14D
継代培養周期: 1 M  
遺伝子情報 Mitochondrial DNA ( AB930144 ) , 18S rRNA ( DQ980478 ) , 28S rRNA ( DQ980468 DQ980469 ) , actin ( DQ980417 DQ980418 DQ980438 ) , alpha-tubulin ( DQ980487 DQ980488 DQ980532 DQ980533 ) , beta-tubulin ( AB194979 DQ980520 DQ980513 DQ980514 DQ980519 ) , EFL ( AB377267 ) , Hsp90 ( ABJ80934 DQ980442 DQ980443 DQ980444 ) , rbcL ( AB510942 )  
特性 ゲノム解読株 (Nishimura, Y. et al. 2014) ; 原生動物 (NIES-1334, NIES-1335) の餌に使用  
サイズ (min - max) - 5 μm  
体制 単細胞性; 鞭毛性 
その他の株番号 その他の株番号:TKB-079 (nrc063)  
注意事項  
動画  
文献
Nishimura, Y., Kamikawa, R., Hashimoto, T., Inagaki, Y. 2014 An intronic open reading frame was released from one of group II introns in the mitochondrial genome of the haptophyte Chrysochromulina sp. NIES-1333. Mobile Genetic Elements, 4, e29384 (article ID).
キーワード: group II intron; mitochondrial genome; intron encoded protein; lateral intron transfer; Chrysochromulina sp.
Strain(s): 1333 

Nishimura, Y., Kamikawa, R., Hashimoto, T., Inagaki, Y. 2012 Separate origins of group I introns in two mitochondrial genes of the katablepharid Leucocryptos marina. PLoS One, 7, e37307 (article ID).
Strain(s): 13331335 
DOI: 10.1371/journal.pone.0037307

Kim, E., Simpson, A. G., Graham, L. E. 2006 Evolutionary relationships of apusomonads inferred from taxon-rich analyses of nuclear encoded genes. Mol. Biol. Evol., 23, 2455-2466.
キーワード: Apusomonas; Apusomonadidae; Opisthokonta; Amoebozoa; protists; evolution
Strain(s): 93695513331335 
DOI: 10.1093/molbev/msl120

Okamoto, N., Inouye, I. 2005 The katablepharids are a distant sister group of the Cryptophyta: a proposal for Katablepharidophyta divisio nova/Kathablepharida phylum novum based on SSU rDNA and beta-tubulin phylogeny. Protist, 156, 163-179.
キーワード: beta-tubulin; Cryptophyta; Katablepharidophyta/Kathablepharida; Katablepharis/Kathablepharis japonica; Leucocrypta; Leucocryptos marina; phylogeny; SSU rDNA
Strain(s): 133313341335 
DOI: 10.1016/j.protis.2004.12.003

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